2022년 11월 6일 일요일

[그래프 그리는 사이트] Volcano Plot

 [그래프 그리는 사이트] Volcano Plot


site : Volcano_Plot


In the example data, there are only 4 columns that are actually used: 
'outcome' 'logFC' 'PValue' 'labels'.
예제 데이터에서 실제 사용되는 열은 
'outcome' 'logFC' 'PValue' 'labels' 즉 4개의 열뿐입니다.



In the end, 'logFC' is used as the x-axis, 'PValue' is used as the value on the y-axis, 
and the value of 'outcome' is expressed as the color of the point.
결국'logFC'은 x축으로 'PValue'는 y축의 값으로 사용되며,  
'outcome'의 값은 점의 색으로 표현됩니다. 


'type2' expresses the y-axis in log scale,
The value in the 'labels' column is displayed through 'show label'.
'type2'는 y축을 로그스케일로 표현하며
'show label'을 통해 'labels'열에 있는 값을 표시해 줍니다. 


This is to display points with small p-values ​​and points with logFC far from zero.
It looks like a volcano exploding.
결국 많은 점들 중에서 p값이 작고 logFC가 0으로부터 먼 점들을 표시하기 위한 것입니다. 
모양이 마치 화산이 폭발하는 것같은 모양이군요.


You can specify the size and x-axis name of the point.
You can also easily change the color palette and theme.
점의 크기와 x축 이름을 지정할 수 있습니다. 
또 색 파레트와 테마도 쉽게 바꿀 수 있습니다.


'plot download'를 통해서 plot size를 조절하세요. 
< PDF >, < SVG > < pptx >를 클릭하면 각각의 형식으로 다운로드 받을 수 있습니다.

Adjust the plot size through 'plot download'.
You can download each format by clicking < PDF >, < SVG > < pptx >.


당신의 데이터를 업로드 하려면 'want to use'를 활성화한 다음, 'Browse'를 클릭하세요.
오직 csv 파일만이 사용가능합니다.
Activate 'want to use' to upload your data, then click 'Browse'.
Only csv file is available.


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